战争机器的故事发生在一名联盟士兵──马可斯的身上。在监狱服刑四年后被他的朋友多姆拯救出来,并且加入了D小队。长官霍夫曼上校授予D小队的任务是,与A小队的幸存者巴德、柯尔会合,并取得A小队携带的位置共鸣器,这个共鸣器是用来探测地下洞穴并画出兽族地底通道的地图,接着发射光子导弹来摧毁兽族的要塞。D小队后来和A小队会合并得到了这个共鸣器,但途中D小队队员安东尼。卡敏被狙杀而队长金名扬被兰姆大将军一刀刺死。混乱中,他们得到游民的帮助,于是马可斯带领D小队顺利穿过Sera行星的废墟城市,最后乘车来到了一个采矿工厂,并且经由工厂到达了地底深处的矿坑。之前《小美人鱼》导演回应女主选角,称人们仍存在偏见。他说:“某种意义来说,我觉得我们已经过了那种事(在意种族)的年代,但现在又意识到其实还没有过。我看到了这种选角对世界有多重要,非常打动我的心。”